Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms