Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TPRP12270 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms