Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm5849J3QPE5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm5849J3QPE5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm5849J3QPE5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm5849J3QPE5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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