Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmQ9QXG2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms