Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC180Q9P1Z9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms