Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WSCD1Q658N2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms