Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sec31aQ3UPL0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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