Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms