Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms