Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKAB2O43741 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms