Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms