Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF13BQ9Y275 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms