Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms