Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Mindy1Q76LS9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Mindy1Q76LS9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Mindy1Q76LS9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mindy1Q76LS9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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