Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms