Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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