Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBRQ0VD83 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms