Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSFQ9UBX1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms