Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SALL1Q9NSC2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL1Q9NSC2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL1Q9NSC2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL1Q9NSC2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL1Q9NSC2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL1Q9NSC2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SALL1Q9NSC2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms