Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pfn4Q9D6I3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms