Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THUMPD2Q9BTF0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms