Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms