Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms