Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
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CNGA3Q16281 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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CNGA3Q16281 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNGA3Q16281 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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