Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETFDHQ16134 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms