Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms