Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scg2Q03517 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms