Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD4P46934 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms