Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRHP20396 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRHP20396 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRHP20396 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRHP20396 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRHP20396 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRHP20396 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRHP20396 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRHP20396 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRHP20396 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRHP20396 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms