Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tube1Q9D6T1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms