Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms