Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms