Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms