Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cspg5Q71M36 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms