Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PTPROQ16827 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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