Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXF2Q12947 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXF2Q12947 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXF2Q12947 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms