Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms