Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PPFIA4O75335 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms