Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ssxb8B1AY40 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ssxb8B1AY40 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ssxb8B1AY40 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssxb8B1AY40 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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