Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL33A6NCF5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL33A6NCF5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms