Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PARP3Q9Y6F1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PARP3Q9Y6F1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PARP3Q9Y6F1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PARP3Q9Y6F1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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