Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms