Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F12Q9HCS2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms