Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTV1Q96GA3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms