Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6kb1Q8BSK8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms