Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHYHD1Q5SRE7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms