Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2iP60898 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2iP60898 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2iP60898 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2iP60898 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2iP60898 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2iP60898 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2iP60898 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2iP60898 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2iP60898 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2iP60898 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2iP60898 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2iP60898 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr2iP60898 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms