Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NGFRP08138 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms