Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms