Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms